MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 270788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014318	ACCT	2	8	223726	223733	25 %	25 %	0 %	50 %	300782146
6002	NC_014318	CG	3	6	223753	223758	0 %	0 %	50 %	50 %	300782146
6003	NC_014318	GATC	2	8	223767	223774	25 %	25 %	25 %	25 %	300782146
6004	NC_014318	CGG	2	6	223823	223828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782146
6005	NC_014318	CGA	2	6	223878	223883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6006	NC_014318	GTC	2	6	223909	223914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6007	NC_014318	TGC	2	6	224027	224032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6008	NC_014318	CGA	2	6	224043	224048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6009	NC_014318	CCTG	2	8	224060	224067	0 %	25 %	25 %	50 %	300782146
6010	NC_014318	TGC	2	6	224228	224233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6011	NC_014318	GGC	2	6	224234	224239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782146
6012	NC_014318	CGG	2	6	224289	224294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782146
6013	NC_014318	CGA	2	6	224304	224309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6014	NC_014318	CGG	2	6	224346	224351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782146
6015	NC_014318	CGC	2	6	224387	224392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782146
6016	NC_014318	GAC	2	6	224397	224402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6017	NC_014318	CCG	2	6	224408	224413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782146
6018	NC_014318	CCG	2	6	224438	224443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782146
6019	NC_014318	CGGG	2	8	224456	224463	0 %	0 %	75 %	25 %	300782146
6020	NC_014318	GAC	2	6	224482	224487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6021	NC_014318	GTC	2	6	224524	224529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6022	NC_014318	TGA	2	6	224546	224551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300782146
6023	NC_014318	GAC	2	6	224563	224568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6024	NC_014318	CGA	2	6	224589	224594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6025	NC_014318	CGG	2	6	224598	224603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782146
6026	NC_014318	TCA	2	6	224654	224659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782146
6027	NC_014318	CCGG	2	8	224660	224667	0 %	0 %	50 %	50 %	300782146
6028	NC_014318	CGA	2	6	224709	224714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6029	NC_014318	CG	3	6	224727	224732	0 %	0 %	50 %	50 %	300782146
6030	NC_014318	CGG	3	9	224735	224743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782146
6031	NC_014318	GTG	2	6	224755	224760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782146
6032	NC_014318	GCC	2	6	224770	224775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782146
6033	NC_014318	GCT	2	6	224904	224909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782146
6034	NC_014318	CGA	2	6	224971	224976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6035	NC_014318	TGC	3	9	224992	225000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6036	NC_014318	CAC	2	6	225024	225029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300782147
6037	NC_014318	CGT	2	6	225088	225093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6038	NC_014318	CGT	2	6	225190	225195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6039	NC_014318	CAC	2	6	225200	225205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300782147
6040	NC_014318	CGGCGC	2	12	225206	225217	0 %	0 %	50 %	50 %	300782147
6041	NC_014318	AGG	2	6	225238	225243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782147
6042	NC_014318	CGG	2	6	225244	225249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782147
6043	NC_014318	AGC	2	6	225262	225267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6044	NC_014318	AGG	2	6	225283	225288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782147
6045	NC_014318	CGG	2	6	225293	225298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782147
6046	NC_014318	CAT	2	6	225335	225340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782147
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6048	NC_014318	CG	3	6	225362	225367	0 %	0 %	50 %	50 %	300782147
6049	NC_014318	ACGT	2	8	225411	225418	25 %	25 %	25 %	25 %	300782147
6050	NC_014318	CGA	2	6	225422	225427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6051	NC_014318	AAG	2	6	225456	225461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782147
6052	NC_014318	CG	3	6	225539	225544	0 %	0 %	50 %	50 %	300782147
6053	NC_014318	CGACCT	2	12	225551	225562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	300782147
6054	NC_014318	GAA	2	6	225596	225601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782147
6055	NC_014318	CG	3	6	225612	225617	0 %	0 %	50 %	50 %	300782147
6056	NC_014318	ACA	2	6	225622	225627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300782147
6057	NC_014318	CGG	3	9	225636	225644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782147
6058	NC_014318	ACT	2	6	225679	225684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782147
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6060	NC_014318	CGT	2	6	225764	225769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6061	NC_014318	GAA	2	6	225792	225797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782147
6062	NC_014318	GTC	2	6	225828	225833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6063	NC_014318	TGC	2	6	225865	225870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6064	NC_014318	CGA	2	6	225902	225907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782147
6065	NC_014318	GGC	2	6	225943	225948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782147
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6067	NC_014318	CGG	2	6	226035	226040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782148
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6069	NC_014318	GCC	2	6	226078	226083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782148
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6072	NC_014318	GCT	2	6	226147	226152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782148
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6088	NC_014318	GCC	2	6	226694	226699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782148
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6091	NC_014318	CGA	2	6	226774	226779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782148
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6099	NC_014318	CG	3	6	226983	226988	0 %	0 %	50 %	50 %	300782148
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6101	NC_014318	GCCG	2	8	227129	227136	0 %	0 %	50 %	50 %	300782148
6102	NC_014318	CTG	2	6	227204	227209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782148
6103	NC_014318	GCC	2	6	227220	227225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782148
6104	NC_014318	GAG	2	6	227244	227249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782148
6105	NC_014318	GAC	2	6	227260	227265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782149
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6107	NC_014318	CGT	2	6	227326	227331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782149
6108	NC_014318	GGTG	2	8	227334	227341	0 %	25 %	75 %	0 %	300782149
6109	NC_014318	CTG	2	6	227348	227353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782149
6110	NC_014318	AGC	2	6	227373	227378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782149
6111	NC_014318	GGC	2	6	227380	227385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782149
6112	NC_014318	GTC	2	6	227431	227436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782149
6113	NC_014318	GAT	2	6	227494	227499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300782149
6114	NC_014318	CGA	2	6	227503	227508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782149
6115	NC_014318	GC	3	6	227538	227543	0 %	0 %	50 %	50 %	300782149
6116	NC_014318	GCTC	2	8	227559	227566	0 %	25 %	25 %	50 %	300782149
6117	NC_014318	CTG	2	6	227600	227605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782149
6118	NC_014318	GCCCGC	2	12	227636	227647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782149
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6120	NC_014318	TGG	2	6	227697	227702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782149
6121	NC_014318	GGC	2	6	227713	227718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782149
6122	NC_014318	CG	4	8	227742	227749	0 %	0 %	50 %	50 %	300782149
6123	NC_014318	TGC	2	6	227787	227792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782149
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6222	NC_014318	CGT	2	6	231088	231093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782152
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6224	NC_014318	CGA	2	6	231127	231132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782152
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6226	NC_014318	GGCTCG	2	12	231359	231370	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300782153
6227	NC_014318	CTCG	2	8	231384	231391	0 %	25 %	25 %	50 %	300782153
6228	NC_014318	GTG	2	6	231400	231405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782153
6229	NC_014318	CAA	2	6	231438	231443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300782153
6230	NC_014318	CGG	2	6	231450	231455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782153
6231	NC_014318	CCCG	2	8	231522	231529	0 %	0 %	25 %	75 %	300782153
6232	NC_014318	CGC	2	6	231539	231544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782153
6233	NC_014318	GCC	2	6	231548	231553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782153
6234	NC_014318	CTG	2	6	231562	231567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782153
6235	NC_014318	CTG	2	6	231652	231657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782153
6236	NC_014318	AGC	2	6	231658	231663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782153
6237	NC_014318	GTC	2	6	231664	231669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782153
6238	NC_014318	CGG	2	6	231674	231679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782153
6239	NC_014318	CGC	2	6	231715	231720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782153
6240	NC_014318	GGC	2	6	231735	231740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782153
6241	NC_014318	CTG	2	6	231748	231753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782153
6242	NC_014318	GTC	2	6	231754	231759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782153
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6353	NC_014318	CG	3	6	235999	236004	0 %	0 %	50 %	50 %	300782157
6354	NC_014318	GCCA	2	8	236021	236028	25 %	0 %	25 %	50 %	300782157
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6358	NC_014318	CGA	2	6	236160	236165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782157
6359	NC_014318	CCAG	2	8	236202	236209	25 %	0 %	25 %	50 %	300782157
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6361	NC_014318	GCA	2	6	236283	236288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782157
6362	NC_014318	GTA	2	6	236350	236355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300782157
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6479	NC_014318	CGGGC	2	10	240875	240884	0 %	0 %	60 %	40 %	300782161
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6481	NC_014318	CGG	2	6	240902	240907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782161
6482	NC_014318	CGG	2	6	240917	240922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782161
6483	NC_014318	GTC	2	6	241067	241072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782162
6484	NC_014318	CG	3	6	241073	241078	0 %	0 %	50 %	50 %	300782162
6485	NC_014318	CGG	2	6	241083	241088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782162
6486	NC_014318	CGG	2	6	241119	241124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782162
6487	NC_014318	GCC	2	6	241133	241138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782162
6488	NC_014318	CAG	2	6	241162	241167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782162
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6490	NC_014318	CGC	2	6	241272	241277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782162
6491	NC_014318	GTG	2	6	241310	241315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782162
6492	NC_014318	CGT	2	6	241339	241344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782162
6493	NC_014318	TCG	2	6	241347	241352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782162
6494	NC_014318	TGC	2	6	241362	241367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782162
6495	NC_014318	GCC	2	6	241408	241413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782162
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6497	NC_014318	TGC	2	6	241440	241445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782162
6498	NC_014318	GCT	3	9	241456	241464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782162
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6500	NC_014318	GCCGG	2	10	241536	241545	0 %	0 %	60 %	40 %	300782162

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